冲绳的海洋里生长着200 多种造礁珊瑚，生息着1000 多种鱼类，这里被认为是世界上生物种类最多的海域。

在冲绳周边海域，珊瑚礁生长繁盛，冲绳所有的岛屿都有着一条美丽的珊瑚花边，其中有些岛屿本身就是因海底的珊瑚礁隆起而形成的。可以说，整个冲绳就是一个珊瑚礁群岛。

珊瑚（刺胞生物）不断繁殖，其分泌出的石灰质骨骼堆积被海浪冲毁后又重新堆积，经过漫长的岁月，形成了珊瑚礁地形。这些珊瑚礁构成一个碎浪区，来自外洋的凶猛的海浪撞击在珊瑚礁上，势力大减，从而使岛屿得到保护。此外，白浪会使更多的氧气融入海中。同时，在这些珊瑚礁的内侧，形成一个风平浪静的浅滩环礁湖（冲绳方言为YINO），很多生物就在这里寻找适于其生存的环境并栖身下来。

因受海洋暖流黑潮影响程度的不同，冲绳很多岛屿有着相互不同的珊瑚种类和珊瑚礁形态。这种复杂的地形也是冲绳亚热带海洋生物多样化的缘由。

在流经冲绳洋面的黑潮海流中，有着鲣鱼、金枪鱼、蝠鲼鱼、鲸鲨鱼等鱼类，群岛的周边也是座头鲸鱼的繁殖地。同时，在与外洋的交界处，绚丽多彩的热带鱼在繁盛的珊瑚群中欢快畅游。在被称为亚热带生物宝库的冲绳，生长着200 多种造礁珊瑚，栖身着1000 多种鱼类，并且，每年还不断发现很多新的鱼类。为了观赏冲绳丰富的水中生物和海洋地貌，除了日本国内的潜水爱好者外，每年还有很多海外的潜水爱好者远道来此，一睹冲绳迷人的海中世界。

位于海岸线与珊瑚礁之间的环礁湖（YINO），风平浪静，这里生长着大叶藻等海草，海草丛中生息着很多小鱼及其他小生物。有时甚至还能看到食草生物海牛（俗称人鱼）。

冲绳海域地貌形态多样，除了珊瑚礁以外，还有如西表岛的亚热带原生林、河口处的红树林沼泽地以及海滩、泥沙藻地等，其中包括受拉姆萨尔条约保护的沼泽地。此外，在冲绳海域还能看到很多属于其它生态系统的生物。

毋庸置疑，如何保护冲绳富饶美好的自然生态环境，并使其世代相传，这是每一个日本人的责任。